为探索北京大学生命科学学院公用仪器管理模式，为学院科研发展提供硬件服务保障，“生命科学学院公用仪器中心”于2009年9月成立（以下简称“仪器中心”)，负责学院公用仪器的管理。
仪器中心旨在为广大师生提供多方位高效、优质的科研服务和技术支撑，包括接受委托测试、培训学生独立使用仪器设备、协助学生完成数据处理、开设仪器和实验技术类研究生课程、聘请专家举办新仪器、新技术讲座、新型仪器Demo机试用、调研科研组仪器使用意见和需求等。
仪器中心实行“主任监管下的平台组长负责制”。主任对全院教师负责，对各仪器平台进行统筹管理、监督和考核。各平台组长对主任负责，依据既定的管理规则独立组织相应类别仪器的管理、运行和服务。仪器中心下设若干仪器管理平台，每个平台负责一大类公共仪器的运行、管理和服务。
中心目前已建立测序平台、生物成像平台、流式细胞平台及同位素实验室。成像平台已拥有双光子激光共聚焦显微镜、200千伏透射电镜及制样设备、活细胞工作站、转盘式激光共聚焦显微镜、高内涵活细胞分析仪、SIM、STORM及离子电导显微镜等8套大型成像设备。测序平台包括AB 3730XL测序仪及配套设备。流式细胞平台包括Moflo细胞分选仪等，同位素实验室实行专人管理，目前可以开展P-32，S-35,C-14，H-3等四种核素的实验。
中心大型仪器的采购、管理和运行遵循“公开、公平、透明”的原则，所有仪器面向生命科学学院全体用户开放，并采取“24小时开放”的服务原则。自2009年成立以来，已有60多个课题组使用中心仪器进行测试，取得了较好的服务效果，中心因此被评为“2012年度北京大学实验室工作先进集体”。